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HPC中国研发团队

微软中国研发集团服务器与开发工具事业部高性能开发团队的中文博客。
高性能计算系统栈的推倒和重建(三)微处理机初期

望洋兴叹

在专有机时代作并行计算的研究,你得会投“胎”。当时,全球科研的浪尖是在美国,能在Communications of ACM上发表论文的,都是美国大学的。用的HyperCube, Cray,Connection Machine 2 等大型机。而在英国,只有国产Transputer。 更可悲的是,我所在的埃德塞特大学(Exeter University), 我们当时只有四个transputer 节点。当时在英国,可以说是望着大西洋对岸的美国兴叹啊!我看美国人的论文的心情,就好比是一个穷人家的孩子偏偏喜欢上摄影,然后看着有钱人家的少爷拿着长焦、广角镜头,口水只能往里咽。

1993年,我到了美国阿冈(Argonne)国家实验室后,我就好像是小孩进了糖果店,因为那里有不少专有机(CM2, Paragon, Sequent等)。我问秘书预订了每个专有机的用户手册。每个手册都有电话簿那么厚,当秘书象我小时搬蜂窝煤一样把几英尺厚的手册搬进我的办公室后,她累得大抒一口气。现在看来,真是浪费了,这些手册我都没有用过。不是我没有用功,而是专有机被第一批微处理机颠覆了!

消息传送库pvm, P4和 MPI

在80年代时候,多种消息传输环境被开发出来。有些是为专有机开发的Ncube. 而另外不少是为Unix工作站开发的。比较有名的是Oak Ridge 实验室的PVM (Parallel Virtual Machines) 和阿冈(Argonne) P4 和PICL, Ohio 超级计算机中心的LAM。

当我看到PVM 的时候,我也就不望洋兴叹了。因为用工作站组装成一个超级计算机,不用花大钱去买专有机。而且写程序也是用常见的C或Fortran语言。不需要专有的语言。 一下子,高性能计算的世界在我眼前变平了。

到了1992年末,听说又要搞个什么MPI。我和一帮英国同事都在笑,怎么又来一个消息传输库。后来才知道,我们笑得过快。原来,MPI是要吸百家之长、制定工业标准、省得大家重新发明轮子、浪费体力精力脑力人力。 Argonne和Oak Ridge 都是美国能源部的实验室。两个实验室,为了一个消息传输库争夺用户,结果使得能源部的应用开发成本提高两倍,这是实在说不过去。1994年这个标准终于出来了,不到两年的时间出来了这个标准,在HPC领域是相当快的。而且有许多学术界的人士参加的标准Forum, 一向是拖拖拉拉,没有目标导向,企图把海水烧开。为什么MPIForum 能够如此神速地推出此标准呢?

这要归功于两个人,Bill Gropp 和 Rusty Lusk, 他们都是从阿冈国家实验室的科学家。不要笑,他们的抬头就是“科学家”。

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Bill Gropp Rusty Lusk

他们告诉我,最重要的原因,是MPI一开始就有一个参考实现:MPICH。 是他们两人主写的代码。所以,一旦有了一个可以参考的MPI库。一些应用就可以开始并行化。这样,许多没有任何应用场景的“好主意”,就很容易被扔到“Out of scope”栏目。帮助参加讨论者集中注意力。还有,他们采用的方法是一天早中晚连轴转的方式,如此高强度的讨论,只有那些铁杆、硬核的人才能挺得过去。所以,也把一些不懂行,不委身、但往往容易随机化讨论的人自然淘汰出局。

很多人把集群的概念归于Beauwolf. 其实,集群已经在九十年代初,就有了。许多人都以为,是beauwolf 集群后,工业界才开始使用。历史并非如此。听我给同学们表来。

制造业最早的投入生产的微处理机集群

在美国East Hartford,驻扎着著名飞机发动机厂商 Pratt Whitney的设计中心。过去,为了测验叶片的强度,他们要将一个冰冻鸡扔向高速旋转的发动机上,然后分析断面。 毫无疑问,造价极高。后来,他们使用Cray来做模拟仿真。只是能够模拟单叶片。而且Cray成为稀有资源,每个工程师的作业,都要排上两天才能算上题。

90年代上半叶,Pratt Whitney的CFD组,开始自主设计、开发一套消息传递系统,Prowess。它可以扩展到上千台太阳工作站。其中带头人名叫Craig Fischberg, 因此在制造业界成名。95年左右,GE 飞机发动机给了他双倍工资并为其妻子安排了很好的工作,把他挖了去。后来,他又用MPI 来为GE建立了同样系统。从此,他在GE 的地位如日中升。

一想起工作站资源觅食(Cycle Scavenging)人人都以为最早是由Seti@home. 其实,在九十年代初在Pratt Whitney 已经有了。

那么从Cray 到工作站集群到底带来什么大不了的效益,使得GE出血本要挖人才呢? 后来,Craig Fischberg 跟我讲,以前只能在叶片上模拟,后来能够把模拟整个发动机。以前的排队时间长至3天,结果晚上提交,第二天一早就可以看见结果。结果呢,高耗资的物理测试减少了,设计时间缩短了一半,而且飞机引擎的油耗效率大大提高。所以,GE能不受刺激吗?花了双倍工资挖到了Craig Fischberg是非常小的代价。

成百上千的工作站的计算能力被完全释放出来。他们用的作业调度器是Platform Computing 的LSF。 所以,在九十年代,LSF的用户手册写着“Unleashing the Power” – 释放能力!就是从这儿来的。

商家简介

机器厂商

IBM,SGI, HP 和SUN

硬件

精简指令芯片

处理器间网络联接

定制化的网络

应用软件编程界面

MPI-工业标准 PVM 和其他 消息传递软件包

作业调度软件

LSF, PBS, Sun Grid Engine (SGE)

 

为什么会有那么多的定制化的网络联接呢?我们下次再说。

下次内容: 我和Rusty Lusk 的一个不开心遭遇引发我的奇想。

Posted: Thursday, September 03, 2009 11:13 AM by mingqxu

Comments

story lover said:

"下次内容: 我和Rusty Lusk 的一个不开心遭遇引发我的奇想。"

期待下一个精彩的故事...

# September 3, 2009 8:53 PM
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