MOM Team の blog で、Operations Manager 2007 や Essentials 2007 がどのようにコンピュータを検出し、エージェントを送り込むのか流れを示した図が掲載されています。 

How does Computer Discovery Work in OpsMgr 2007?
http://blogs.technet.com/momteam/archive/2007/12/10/how-does-computer-discovery-work-in-opsmgr-2007.aspx

おそらく、予測したとおりだとは思いますが、このように流れが見えると不測の事態の際に現象を把握しやすくなりますね。