マイクロソフト セキュリティ サポートの斉藤です。
親子構成の WSUS 2.0 をアップグレードする場合、上位の階層からアップグレードする必要があります。
また、親子関係がレプリカの場合には下記の問題があるため、WSUS 2.0 と WSUS 3.0 が混在する状況にならないようご注意ください。
Windows Server Update Services 3.0 と Windows Server Update Services 2.0 が混在するレプリカ構成で新規のインストール承認を追加した場合、”期日なし” でインストール承認された更新プログラムに対し、第 2 階層目の WSUS 2.0 サーバーで期日が設定される
<http://support.microsoft.com/kb/968514/ja>
- 参考資料
WSUS 3.0 SP1 へのアップグレード<http://blogs.technet.com/jpwsus/archive/2009/04/22/wsus-3-0-sp1.aspx>