Вот что как я видел (слышал), может быть причиной разрушения БД Navision (.fdb):

- Разрушения на жестком диске
- Проведение backup на базе с активными пользователями, проводящими операции
- Использование всего свободного места в БД

Так же я отсмотрел, что пишется в документации:
(w1w1ism.pdf c Product CD 4.00 SP3)

- Пишут об опасности использования компрессированных дисков

- Так же предупреждают об опасности дискового КЭШа при отсутствии UPS батарей на сервере

- Говорят об опасности использования памяти без контроля четности (ECC)

- Не рекомендуют все-таки делать backup (backup, hotcopy) во время ‘активных’ часов