…Нашел прямой ответ, что давал в одном из своих старых сервисных запросов:

Попробуйте проинсталлировать через командную строку нужное число NAS (через параметр installasservice) и запускать/останавливать сервисы NAS как сервисы Windows, т.е. через net start (stop).

Примечание:  Деинсталлировать “лишний” NAS через параметр uninstallasservice.  Документация w1w1atas.pdf  с  инсталляционного CD.

Я провел на Windows XP Sp2 и Navision 4.00 Sp2 (build 22100) такой тест:

0. Имеется проинсталлированный обычным путем NAS

1. запускаю test-install.bat
***
cd C:\Program Files\Microsoft Business Solutions-Navision 40Sp2\Application Server

nassql.exe appservername=NAS1, servername=I-ALEXEF03, database="Navision Demo Database (4-0)", company="CRONUS1", startupparameter=ADCS, installasservice
nassql.exe appservername=NAS2, servername=I-ALEXEF03, database="Navision Demo Database (4-0)", company="CRONUS2", startupparameter=ADCS, installasservice
***

2. В Windows нахожу список сервисов (Control Panel\Administrative Tools\Services)
у вновь созданных сервисов "Navision Application Server NAS1", "Navision Application Server NAS2" на закладке Log On ставлю запуск от 'боевого' windows account-а (DOMAIN\User), этот же windows account у меня прописан в Navision sql базе и имеет права SUPER.

3. Запускаю test1-start.bat
***
net start "Navision Application Server NAS1"
***

4. запускаю test1-stop.bat
***
net stop "Navision Application Server NAS1"
***

5. запускаю test2-start.bat
***
net start "Navision Application Server NAS2"
***

6. запускаю test2-stop.bat
***
net stop "Navision Application Server NAS2"
***

7. Нахожу в Windows лог событий (Control Panel\Administrative Tools\Event Viewer\Application) и смотрю, нет ли ошибок, нет вроде все Okay, сообщения об успешных запусках, остановках NAS присутствуют.